Հազարամյակի մարտահրավեր հիմնադրամ կազմակերպությունների համար կարևոր են մի շարք հաշվետվություններ, որոնց շնորհիվ կազմակերպության գործունեությունը մատչելի է դառնում հանրությանը և դոնոր կազմակերպություններին` իրազեկելով կատարված աշխատանքների և արդյունքների վերաբերյալ, այդպիսով իսկ, ապահովելով բոլոր գործունեությունների թափանցիկությունը:
Վերոհիշյալ հաշվետվություններից են ` ֆինանսական հաշվետվությունները, որոնք կցվում են եռեամսյակային հատկացման հայտին, ներկայացվում երեք ամիսը մեկ, աուդիտի հաշվետվությունները, որը ներկայացվում է վեց ամսյա կտրվածքով, ինչպես նաև տարեկան հաշվետվությունը` տարեկան կտրվածքով: